MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	A	6	6	3	8	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013161	TCA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013161	AATT	2	8	49	56	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013161	TAA	2	6	76	81	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013161	C	6	6	108	113	0 %	0 %	0 %	100 %	257057920
6	NC_013161	TAT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
7	NC_013161	TCAA	2	8	429	436	50 %	25 %	0 %	25 %	257057920
8	NC_013161	GGTC	2	8	469	476	0 %	25 %	50 %	25 %	257057920
9	NC_013161	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
10	NC_013161	G	7	7	557	563	0 %	0 %	100 %	0 %	257057920
11	NC_013161	T	6	6	636	641	0 %	100 %	0 %	0 %	257057920
12	NC_013161	TCG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
13	NC_013161	T	6	6	733	738	0 %	100 %	0 %	0 %	257057920
14	NC_013161	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057920
15	NC_013161	AAG	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
16	NC_013161	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
17	NC_013161	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057920
18	NC_013161	A	6	6	965	970	100 %	0 %	0 %	0 %	257057920
19	NC_013161	AT	3	6	1012	1017	50 %	50 %	0 %	0 %	257057920
20	NC_013161	ACTA	2	8	1022	1029	50 %	25 %	0 %	25 %	257057920
21	NC_013161	TCC	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057920
22	NC_013161	ACGG	2	8	1177	1184	25 %	0 %	50 %	25 %	257057920
23	NC_013161	ATCG	2	8	1204	1211	25 %	25 %	25 %	25 %	257057920
24	NC_013161	CGA	2	6	1232	1237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057920
25	NC_013161	GAGTT	2	10	1292	1301	20 %	40 %	40 %	0 %	257057920
26	NC_013161	GAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
27	NC_013161	TA	3	6	1350	1355	50 %	50 %	0 %	0 %	257057920
28	NC_013161	T	6	6	1515	1520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013161	TTC	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013161	AAC	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013161	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013161	TTAA	2	8	1778	1785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013161	CGAT	2	8	1815	1822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013161	AT	4	8	1827	1834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013161	ATC	2	6	1916	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
36	NC_013161	A	6	6	1948	1953	100 %	0 %	0 %	0 %	257057921
37	NC_013161	ACAA	2	8	1959	1966	75 %	0 %	0 %	25 %	257057921
38	NC_013161	A	7	7	1978	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	257057921
39	NC_013161	AAT	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
40	NC_013161	CGT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
41	NC_013161	ATT	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
42	NC_013161	TTAA	2	8	2197	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	257057921
43	NC_013161	TTG	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
44	NC_013161	AAAAT	2	10	2275	2284	80 %	20 %	0 %	0 %	257057921
45	NC_013161	AGC	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057921
46	NC_013161	GTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
47	NC_013161	AAT	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
48	NC_013161	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
49	NC_013161	GAA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057921
50	NC_013161	CAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
51	NC_013161	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
52	NC_013161	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
53	NC_013161	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
54	NC_013161	ATG	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057921
55	NC_013161	TTG	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
56	NC_013161	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	257057921
57	NC_013161	ATA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
58	NC_013161	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057921
59	NC_013161	CAAT	2	8	2799	2806	50 %	25 %	0 %	25 %	257057921
60	NC_013161	ACA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
61	NC_013161	CAAG	2	8	2907	2914	50 %	0 %	25 %	25 %	257057921
62	NC_013161	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	257057921
63	NC_013161	AATT	2	8	2966	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013161	T	6	6	2984	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013161	AC	3	6	3038	3043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013161	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013161	T	6	6	3073	3078	0 %	100 %	0 %	0 %	257057922
68	NC_013161	GGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057922
69	NC_013161	TTC	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
70	NC_013161	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
71	NC_013161	A	6	6	3246	3251	100 %	0 %	0 %	0 %	257057922
72	NC_013161	TA	3	6	3315	3320	50 %	50 %	0 %	0 %	257057922
73	NC_013161	CAAA	2	8	3359	3366	75 %	0 %	0 %	25 %	257057922
74	NC_013161	TGAT	2	8	3373	3380	25 %	50 %	25 %	0 %	257057922
75	NC_013161	CAAC	2	8	3405	3412	50 %	0 %	0 %	50 %	257057922
76	NC_013161	ATA	2	6	3428	3433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
77	NC_013161	TCCG	2	8	3440	3447	0 %	25 %	25 %	50 %	257057922
78	NC_013161	CCCA	2	8	3474	3481	25 %	0 %	0 %	75 %	257057922
79	NC_013161	ATA	2	6	3500	3505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
80	NC_013161	CTAGA	2	10	3515	3524	40 %	20 %	20 %	20 %	257057922
81	NC_013161	AAT	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
82	NC_013161	CCA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057922
83	NC_013161	TAA	2	6	3630	3635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
84	NC_013161	A	8	8	3744	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	257057922
85	NC_013161	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	257057922
86	NC_013161	TTC	2	6	3788	3793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
87	NC_013161	GTT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
88	NC_013161	TTG	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
89	NC_013161	TGA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013161	AAC	2	6	3861	3866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013161	TAA	2	6	3877	3882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013161	TTTA	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013161	AT	3	6	3946	3951	50 %	50 %	0 %	0 %	257057923
94	NC_013161	GTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
95	NC_013161	AGC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057923
96	NC_013161	TAA	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057923
97	NC_013161	AGT	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
98	NC_013161	ATT	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013161	GTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013161	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013161	TTA	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
102	NC_013161	ATT	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
103	NC_013161	CCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057924
104	NC_013161	CCT	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057924
105	NC_013161	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
106	NC_013161	T	6	6	4434	4439	0 %	100 %	0 %	0 %	257057924
107	NC_013161	TGT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057924
108	NC_013161	TTTA	2	8	4462	4469	25 %	75 %	0 %	0 %	257057924
109	NC_013161	TTA	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
110	NC_013161	TAA	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057924
111	NC_013161	AGG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057924
112	NC_013161	TTA	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
113	NC_013161	TTATT	2	10	4635	4644	20 %	80 %	0 %	0 %	257057924
114	NC_013161	TA	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	257057924
115	NC_013161	T	6	6	4661	4666	0 %	100 %	0 %	0 %	257057924
116	NC_013161	ATT	2	6	4668	4673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
117	NC_013161	TTTAGG	2	12	4750	4761	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257057924
118	NC_013161	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
119	NC_013161	TTGT	2	8	4833	4840	0 %	75 %	25 %	0 %	257057924
120	NC_013161	ATT	2	6	4876	4881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
121	NC_013161	TTG	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
122	NC_013161	CAT	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
123	NC_013161	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
124	NC_013161	T	6	6	5292	5297	0 %	100 %	0 %	0 %	257057925
125	NC_013161	TAAT	2	8	5313	5320	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
126	NC_013161	A	6	6	5392	5397	100 %	0 %	0 %	0 %	257057925
127	NC_013161	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
128	NC_013161	T	7	7	5451	5457	0 %	100 %	0 %	0 %	257057925
129	NC_013161	AACC	2	8	5465	5472	50 %	0 %	0 %	50 %	257057925
130	NC_013161	CAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057925
131	NC_013161	TTC	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
132	NC_013161	CTTGA	2	10	5617	5626	20 %	40 %	20 %	20 %	257057925
133	NC_013161	TA	3	6	5628	5633	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
134	NC_013161	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057925
135	NC_013161	AT	3	6	5847	5852	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
136	NC_013161	A	6	6	5886	5891	100 %	0 %	0 %	0 %	257057925
137	NC_013161	TTG	2	6	5959	5964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
138	NC_013161	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
139	NC_013161	CTT	2	6	5979	5984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
140	NC_013161	CA	3	6	6018	6023	50 %	0 %	0 %	50 %	257057925
141	NC_013161	TAA	3	9	6031	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
142	NC_013161	A	6	6	6078	6083	100 %	0 %	0 %	0 %	257057925
143	NC_013161	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
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163	NC_013161	AAGA	2	8	7134	7141	75 %	0 %	25 %	0 %	257057926
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256	NC_013161	A	6	6	11599	11604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013161	CACT	2	8	11653	11660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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265	NC_013161	CTAA	2	8	11947	11954	50 %	25 %	0 %	25 %	257057930
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268	NC_013161	A	6	6	12068	12073	100 %	0 %	0 %	0 %	257057930
269	NC_013161	AT	3	6	12118	12123	50 %	50 %	0 %	0 %	257057931
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271	NC_013161	CTT	2	6	12314	12319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057931
272	NC_013161	GTTT	2	8	12331	12338	0 %	75 %	25 %	0 %	257057931
273	NC_013161	GAT	2	6	12402	12407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057931
274	NC_013161	AATT	2	8	12414	12421	50 %	50 %	0 %	0 %	257057931
275	NC_013161	TTAA	2	8	12472	12479	50 %	50 %	0 %	0 %	257057931
276	NC_013161	TTG	2	6	12489	12494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057931
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402	NC_013161	CAA	2	6	18688	18693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057938
403	NC_013161	TAT	2	6	18758	18763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057938
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405	NC_013161	TATT	2	8	18792	18799	25 %	75 %	0 %	0 %	257057938
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